Нарушения не являются нецелевым расходованием бюджетных средств, однако контрольный орган требует устранить выявленные недостатки.
Сама программа была разработана с нарушениями действующего законодательства. Кроме того, в 2012 году департамент здравоохранения не выполнил ряд мероприятий программы на сумму более миллиона рублей. Учреждения здравоохранения - Окружная клиническая больница и Центр медицинской профилактики - несвоевременно устраняли нарушения в ходе поставки расходных материалов.
Счётная палата направила директору департамента Александру Филимонову, а также главным врачам Окружной клинической больницы, Няганской окружной больницы и Центра медицинской профилактики требования устранить выявленные нарушения.