До этого Колупаев работал в качестве замглавы департамента экономического развития. Эту должность он получил в 2019 году. В ведомстве Роман занимался курирование инвестиционной политики.
Роман Колупаев участвовал в разработке закона о господдержке инвестиционной деятельности. Также он был причастен к закону о креативной деятельности. Также он занимался руководством портфеля проектов «Малое и среднее предпринимательство».